Solution pour mettre en place le diagnostic virologique de la grippe A(H1N1) 2009

A. Les solutions disponibles pour mettre en place une analyse par RT-PCR

1) Test de RT-PCR mis au point par les Centres Nationaux de Références (CNR) pour la grippe

La procédure de détection A(H1N1)2009 mise au point par les CNR est décrite dans le document « Procédures CNR ».
« Procédures CNR » (PDF - 93.5 ko)

Pour la détection spécifique du virus H1N12009 par RT-PCR, la RT-PCR ciblant le gène M pour la détection des virus influenza A sera complétée par la RT-PCR H1 2009 et/ou la RT-PCR N1 2009.

Les CNR tiennent à la disposition des laboratoires qui choisiront cette première solution les transcrits servant de témoin positif.

En fonction de votre localisation (Sud ou Nord de la Loire), vous contacterez votre CNR d’appartenance géographique :

2) Trousses commerciales de RT-PCR

Plusieurs trousses commerciales de détection du virus H1N1 pandémique sont maintenant disponibles.

L’Agence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de Santé (AFSSAPS) a mis en ligne une liste des différents dispositifs disponibles sur le marché à usage de diagnostic.
Pour en savoir plus

Il existe également plusieurs kits de RT-PCR dont l’usage est « Research Use Only ». L’emploi de ces outils relèvera alors de votre responsabilité de biologiste, comme pour tout test RUO que vous utilisez.

Une évaluation de la plupart de ces trousses commerciales de détection a été menée par une comparaison avec la technique de détection par RT-PCR en temps réel développée par les CNR. Il ressort de cette étude que l’ensemble des trousses commerciales testées ont une bonne sensibilité et peuvent être utilisées (les résultats de ces travaux réalisés par le groupe de recherche FLUDIAG sont en cours de publication).

B. Les échantillons à envoyer aux CNR :

Compte tenu de la circulation active du virus il n’est pas nécessaire de faire remonter vers les CNR tous vos échantillons positifs. Par contre, il est important que vous fassiez systématiquement parvenir au minimum un aliquote de l’échantillon clinique (au moins 0,5 mL si possible), ou à défaut le produit d’extraction (au moins 50µL) dans les situations suivantes :

• analyse positive réalisée sur un patient traité et présentant une aggravation clinique
• survenue de cas groupés graves d’emblée
• patients immunodéprimés avec excrétion virale prolongée malgré un traitement antiviral adapté
• échecs vaccinaux.